Craig es un marionetista que vive en Nueva York y se encuentra en crisis. Lotte, su mujer, vive totalmente obsesionada con su trabajo en la tienda de animales y la rutina tras diez años de matrimonio se le hace cada vez más insoportable. Un día consigue un trabajo como administrativo en un rascacielo de Manhattan y la vida le empieza a cambiar. Conoce a la deslumbrante Maxine, compañera de trabajo, de la que se enamora perdidamente, pero ésta no le hace caso. Un día, por casualidad, encuentra detrás de un archivador una pequeña puerta que da a un túnel secreto. Cual no será su gran sorpresa al descubrir que esa puerta es el acceso al cuerpo de John Malkovich.